Писатель родился в семье преуспевающего торговца сигарами и закончил очень престижную школу, прошел подготовку к флотской службе при Эдинбургском университете и целых 2 года отслужил морпехом, но военная карьера не задалась.
Джон Фаулз преподавал английский на греческом острове Спеце и там же познакомился со своей будущей женой. Детей у них не было, но он удочерил ребенка Элизабет Анну. Жена сильно повлияла на его дальнейшее творчество и ее черты есть почти в каждой героине его романов.
Очень любил Грецию и называл ее своей "второй родиной".
В 1963 году неизвестный преподаватель литературы опубликовал один из главных бестселлеров XX века - "Коллекционер". Роман о никчёмном молодом человеке, который надеется добиться любви, насильственно удерживая понравившуюся девушку рядом, написан от лица обоих главных героев и вызвал фурор в литературном мире. Публика сразу же окрестила Джона Фаулза "английским Набоковым" (в это время Набоков был очень популярен). Фаулз изобразил главную героиню романа - Миранду - с мальчишеской фигурой и детской незаконченностью черт, далее - мотив погони героя за ускользающей героиней, также сам роман был наполовину написан от лица маньяка, как и "исповедь светлокожего вдовца" в "Лолите", плюс было еще несколько отсылок на Набокова.
Уже через 2 года "Коллекционера" экранизировали и картина собрала несколько номинаций на Оскар. И позволила Фаулзу оставить учительство. С тех пор он занимался писательством "на полную ставку".
Считается, что главный роман Фаулза - "Волхв". В нем присутствуют отсылки к тайным знаниям, юнгианству, алхимии, оккультизму, Кроули и 78 арканам Таро. Собственно, каждая глава книги — и есть описание в художественной форме ситуации каждого из арканов. Маг, на минуточку — тоже карта Таро. Кстати, книгу "Волхв" Джон Фаулз писал более 15 лет! И первоначальное название было "Игра в Бога". Книга была наполнена древнегреческой символикой и закрепила успех автора как литературного интеллектуала. Роман экранизировали в 1968 году с Майклом Кейном, однако сам автор называл эту адаптацию «полнейшей катастрофой».
В «Женщине французского лейтенанта» писатель предложил новаторскую для того времени литературную форму, представляя читателю сразу три варианта развития сюжета на выбор. Этот роман превзошел коммерческий успех «Коллекционера» и закрепил славу Фаулза-постмодерниста.
Джон Фаулз не любил большие города и не скрывал этого: "все города опасны, но этот больше всех" (писал Джон про Лондон), они с женой переехали из Лондона в Лайм-Реджис (на юге страны). Большую часть жизни писатель провел в своем доме на берегу моря и снискал славу замкнутого человека. Также Фаулз считал, что потеря, утрата и изгнание являются основными движущими элементами писателя.
Интерес к истории заставлял литератора появляться на людях. В 1979 году он устроился куратором местного музея в Лайм-Реджисе и работал там до 1988 года, пока не случился инсульт, серьезно подорвавший здоровье Фаулза.
Писатель был дважды женат и умер в 2005 году.